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組織・研究分野

生命情報システム科学 [木下(賢)・大林] 研究室

教員・職員

[PHOTO.1] 教授 木下 賢吾
(生命情報システム科学分野)
[PHOTO.2] 准教授 大林 武
(生命情報システム科学分野)
[PHOTO.3] 助教 西 羽美

私たちの研究室では、ゲノムの配列情報に代表される「生命情報」を情報科学的に扱い、生命システムの理解を目指しています。
従来の生物学は個別の議論を蓄積し、どんどん教科書を分厚くする枚挙の学問でした。 もちろん個別論を見る楽しさは生物学の醍醐味ですが、生命情報ビックバンとも言える急激な生命情報の増加(図1)により、 生物学は大きく様変わりつつあります。
データが増えることはもちろん良い事ですが、データが増えれば増えるほどその処理は大変になってきます。 特に、せっかく情報が増えてもちゃんと処理しないと貴重な情報を失いかねません。 例えば、それぞれの遺伝子の発現量データから計算できる共発現指標という指標があります。 従来は単純に遺伝子ペアの発現量の相関係数を用いていましたが、 我々は、最初に主成分解析を行って主成分空間に射影し、主な主成分を順に抜くことで、多次元共発現度指標を考案し、 この指標が従来指標に比べて遺伝子の機能的関連を上手く表現していることを示しました(図2)。
このように、我々は生命情報ビックバンの時代における新しい情報生物学を目指して、 生命情報を上手に解析するアルゴズムの研究開発を行っています。

東北大学 電気・情報系
〒980-8579 仙台市青葉区荒巻字青葉 6-6-05
TEL : 022-795-7186(教務係)
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